Отдельный стоит дороже на старте - фундамент, стены, кровля сами по себе. В среднем от 400 000 руб. за базовый вариант. Зато пожарная безопасность лучше: бензиновые пары не идут в жилые комнаты, и страховщики это учитывают. Встроенный или пристроенный - удобнее зимой. Вышел из тепла, сел в машину, поехал. Экономия на стенах и кровле - 20-30% от стоимости. Но требует хорошей вентиляции и отдельного противопожарного перекрытия.

По ликвидности: встроенный гараж поднимает цену дома при продаже на 5-8%. Отдельный - на 3-5%, зато не "съедает" полезную площадь дома.
Кому что подходит:
Встроенный - если участок небольшой и важен комфорт зимой
Отдельный - если есть место и планируете мастерскую или хранение
Если выбираете и хотите посчитать под свой участок - пишите на greenguildspb@yandex.ru или звоните: +7 966 922-55-69